温金玉 教授最早为净土宗排祖位的宗晓与志盘皆为天台宗僧。所以在十三祖中，有天台宗四人，禅宗二人，华严宗一人。由其他宗派的人来确立净土祖师，其倾向性、宗派性以及随意性当是不可避免的。
对十三祖质疑之焦点实际最后落在了慧远与昙鸾谁是净土宗的真正奠基者，抑或说是初祖的问题上。目前已有多种论着对此发表新说。如陈扬炯先生就指出：「从历史真相来说，净土宗的真正奠基者、创始者是昙鸾而不是慧远。昙鸾不仅是中国净土宗的初祖，也是国际净土教的初祖。」并认为将慧远定为净土宗初祖，实在是夸大了慧远的作用。
林元白先生在《中国净土教史上玄中寺的地位》一文中也说：「这种念佛方法叫做观像念佛与观念念佛，不是至诚信仰的人是不易持久的。所以远公以后，这一种念佛方法就有些人往风微了。」虽然后世传说他曾在庐山邀请僧俗十八人，即所谓十八高贤立「白莲社」，但据著名佛教史专家汤用彤先生考证，这只是后世念佛者的一种善意的附会。（详见汤用彤着《汉魏两晋南北朝佛教史》上册，第十一章，中华书局出版。）尽管说慧远只是一个一般意义上的净土信仰者，只是一个探索弥陀信仰思想的理论先行者，但他在中国佛教史上却是成就卓着的一代名僧。他高居庐山，培养了一大批弘法僧才，团结高层官吏及士族文人，调和佛教与儒教的矛盾，使佛教得以在中国南方流行发展，并为以后佛教中国化开拓了一条道路，影响极为深远。就弥陀净土信仰来说，有这样道隆德盛、遐迩闻名的高僧来宣导，其影响自不待言。净土宗的确立是在隋唐之时，这是没有疑义的，但慧远崇尚净土，对净土宗的形成所起的推动作用却是应予以充分肯定。
在净土宗史上，至昙鸾大师才专重持名念佛，仰靠他力求生净土。汤用彤先生在《汉魏两晋南北朝佛教史》中明确指出：「北方大弘净土之业者，实为北魏之昙鸾，其影响颇大，故常推为净土教之初祖。」从昙鸾与道绰的生平来看，他们是倾毕生精力与心血来劝导念佛的，这在净土思想初传期是仅有的。我们首先应正视一个历史与现实、传统与当代，都不可改变的事实，那就是中国净土宗发展的理路与承继的血脉，是沿着由昙鸾开创、道绰继之，善导集大成的持名念佛一系而发展的。所以，在净土祖师的位次中是应该专门予以彰显的。